CattleGTEx Fase 1: Et omfattende regulatorisk atlas over kvægets transkriptom
Ph.d.-forsvar, torsdag den 29. januar 2026, Huicong Zhang
I løbet af sit ph.d.-studium har Huicong Zhang forsket i at konstruere det hidtil mest omfattende regulatoriske kort over kvægets genom. Med det formål at kortlægge det fulde regulatoriske landskab har han indsamlet store mængder offentligt tilgængelige RNA-seq-data ved hjælp af en nyudviklet pipeline, hvilket har resulteret i atlasset CattleGTEx Fase 1.
De opnåede forskningsresultater har karakteriseret regulatorisk variation på tværs af 35 væv og yderligere forfinet opløsningen fra vævsniveau ned til specifikke celletyper. Resultatet er en samlet ressource, der gør det muligt for forskere at udpege de molekylære mekanismer bag genetiske associationer, hvilket i høj grad fremmer vores evne til at udnytte genomisk information i kvægavl.
Ph.d.-studiet er gennemført ved Center for Kvantitativ Genetik og Genomforskning (QGG), Faculty of Technical Sciences, Aarhus Universitet.
Dette resumé er udarbejdet af den ph.d.-studerende.
Tid: Torsdag den 29. januar 2026 kl. 10.30.
Sted: 1531-113, Auditorium D1, Aarhus University, Ny Munkegade 116, 8000 Aarhus C
Afhandlingens titel: An updated CattleGTEx resource for functional annotation and regulatory mechanism discovery in cattle
Kontaktinfo: Huicong Zhang, e-mail: huicongz@qgg.au.dk, tlf.: +45 71483918
Bedømmelsesudvalg:
Lektor Monique van der Wijst, University Medical Center Groningen, Nederlandene
Lektor Jordi Merino Ribas, Det Sundhedsvidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet, Danmark
Professor Doug Speed (forperson), Center for Kvantitativ Genetik og Genomforskning (QGG), Aarhus Universitet, Danmark
Hovedvejleder: Seniorforsker Peter Sørensen, Center for Kvantitativ Genetik og Genomforskning (QGG), Aarhus Universitet, Danmark
Medvejleder: Tenure Track Adjunkt Lingzhao Fang, Center for Kvantitativ Genetik og Genomforskning (QGG), Aarhus Universitet, Danmark
Sprog: Ph.d.-afhandlingen forsvares på engelsk
Forsvaret er offentligt.
Afhandlingen ligger til gennemsyn hos Graduate School of Technical Sciences (GSTS), Ny Munkegade 120, bygning 1521, 8000 Aarhus C