Fremskridt indenfor højkapacitetsgenotypebestemmelse og -sekvensering, adgang til store mængder fænotypedata, der rutinemæssigt indsamles i avlsprogrammer, samt en bedre forståelse for genomsekvensvariationen i forskellige husdyrarter har gjort næste generation af genetiske studier mulige. ’Genkortlægnings’ teamets centrale forskningsfokus er at identificere de sekvensvariationer, der spiller en kausal rolle for variation i egenskaber af interesse i husdyrarter.
Vi er interesseret i at udvikle statistiske beregningsmæssige metoder til identifikation af de genetiske varianter, der er medvirkende til Mendelske og komplekse genetiske sygdomme, og som bidrager til variation i de økonomisk interessante egenskaber.
Vi anvender en genotype-dreven tilgang til at identificere recessive, letale mutationer, der typisk er monogene.
Vi er især interesserede i at kortlægge sjældne kausale varianter samt at arbejde med værktøjer, der tolker de funktionelle konsekvenser af sekvensvarianter, herunder ikke-proteinkodende varianter.
Når selektion virker på en mutation, påvirker det også koblede områder, og efterlader et selektionsspor i de omgivende kromosomområder. Vi bruger genomiske data til at studere populationsstruktur og identificere selektionsspor i genomet.
Nøgleområder i vores forskning
1. Helgenomassociationsstudier
2. Komplekse sygdomme og kvantitative egenskabers genetiske arkitektur
3. Helgenomsekvensdataanalyser
4. Identifikation af recessive, skadelige/letale mutationer
5. Evolutionær genetik
6. Selektionsspor
7. Bioinformatiske værktøjer til prioritering af kandidatvarianter