Med projektet ‘Afkodning af genregulering og planters modstandsdygtighed ved hjælp af genomiske sekvensmodeller: prædiktion og fortolkning af varianteffekter i Brachypodium (GRASP)’ er Guillaume Ramstein blandt de 21 forskere, der har modtaget en bevilling under temaet Grøn Forskning. Danmarks Frie Forskningsfond (DFF) modtog i alt 415 ansøgninger til temaopslaget.

Spørgsmålet "Hvordan kan vi bidrage til den grønne omstilling?" er centralt i Guillaume Ramsteins projekt. Fremtidens planteproduktion kræver mere effektive og robuste afgrøder med mindre klimaaftryk. Med klimaændringer som varmere vejr, tørke og andre ekstreme vejrbegivenheder skal afgrøder til ernæring af mennesker og dyr være mere modstandsdygtige. Robusthed er dog en genetisk egenskab, der er vanskelig at forbedre, da den typisk er forårsaget af interaktioner mellem mange DNA-varianter. Nuværende metoder til forbedring af egenskaber i planter er begrænsede, så Guillaume Ramsteins projekt vil udvikle genomiske modeller ved hjælp af kunstig intelligens (AI) for at forudsige genaktivitet baseret på DNA-sekvensen. Disse modeller vil blive brugt til at identificere genetiske forskelle mellem forskellige genotyper med det formål at kortlægge reguleringsprocesser.

For at teste modellerne vil projektet fokusere på varmestress i Brachypodium distachyon, en modelplante tæt beslægtet med byg og hvede, som begge er vigtige i verdens fødevareproduktion. GRASP-projektet vil give ny indsigt i den genetiske kontrol af genregulering og udvikle nye AI-baserede metoder til at forudsige betydningen af genetiske varianter for planters robusthed.

‘- Jeg er glad og taknemmelig for at modtage denne prestigefyldte bevilling,’ siger Guillaume Ramstein og uddyber: ‘DFF Grøn Forskning-bevillingen vil være afgørende for at konsolidere QGGs førerposition inden for prædiktion af varianteffekter, som har været et af de hurtigst voksende områder inden for genomforskning, takket være den hurtige udvikling af AI-teknikker. GRASP-projektet vil etablere et internationalt netværk blandt førende eksperter inden for regulatorisk genomforskning (prof. Peter Koo, Cold Spring Harbor Lab, USA), Brachypodium genetik (Dr. Anne Roulin, Agroscope, Schweiz) og plantefysiologi (prof. Birte Boelt, Institut for Agroøkologi ved Aarhus Universitet). Jeg er meget begejstret for udsigten til at udvikle banebrydende teknikker til prædiktion af variant effekter i samarbejde med disse eksperter, samtidig med at projektet adresserer grundlæggende spørgsmål om genetikken bag stresstolerance hos planter.’

Læs pressemeddelelsen fra Danmarks Frie Forskningsfond her.

For yderligere information, kontakt venligst: Tenure track adjunkt Guillaume Ramstein